ngµç×ÓÓÎÏ·

05

¿ÆÑÐÏ£Íû

ngµç×ÓÓÎÏ·ÍŶӿª·¢È«»ùÒò×é¼ì²âÄæ×ªÂ¼×ª×ù×ÓµÄÐÂÒªÁì

¸å¼þȪԴ£ºÉúÃü¿ÆÑ§Ñ§Ôº ±à¼­£ºÌ¸Ï£¡£¡¢Íõ¶¬Ã· ÉóºË£ºËïÒ«±ó ÔĶÁÁ¿£º

ngµç×ÓÓÎÏ·ÐÂÎÅÍøÑ¶£¨Í¨Ñ¶Ô±Ñ»ª£©Äæ×ªÂ¼×ª×ù×Ó£¨Retrotransposons£©ÔÚ´ó´ó¶¼ÎïÖÖÖж¼ÆÕ±é±£´æ£¬£¬Äܹ»Í¨¹ý¡°¸´ÖÆ-Õ³Ìù¡±»úÖÆ¾ÙÐдó×ÚÀ©Ôö£¬£¬ÔÚÈËÀà»ùÒò×éÖÐÕ¼±ÈÁè¼Ý35%¡£¡£¡£Äæ×ªÂ¼×ª×ù×Ó¿ÉÒÔΪ´´Á¢ÐµĹ¦Ð§»ùÒòÌṩÖÊÁÏ£¬£¬Êǽø»¯¶àÑùÐÔµÄ×îÖ÷ҪȪԴ֮һ¡£¡£¡£ËüÃÇÄÜÒý·¢Ã÷ÓлùÒòÐòÁеĸı䣬£¬»ò³äµ±Ð»ùÒòµÄÆô¶¯×Ó£¬£¬Ó°Ïì»ùÒòÑ¡ÔñÐÔ¼ô½Ó£¬£¬ÉõÖÁ´ÙʹлùÒòÐγÉ¡£¡£¡£¾ßÓбí´ïDZÄܵÄÄæ×ªÂ¼×ª×ù×Ó¶ÔÈËÌåÐÄÀí¡¢×éÖ¯·Ö»¯¡¢°©Ö¢µÄ±¬·¢¿ªÕ¹¾ßÓÐÉîÔ¶µÄÓ°Ï죬£¬ÇÒ±»ÒÔΪÔÚ²¸È鶯Îï´óÄÔ½ø»¯ÖÐÊÎÑÝÖ÷Òª½ÇÉ«¡£¡£¡£È»¶ø£¬£¬ÏÖÓеÄÄæ×ªÂ¼×ª×ù×Ó¼ì²âÒªÁì±£´æ¾ÖÏÞ£¬£¬ÐèÒªÒÑ֪ȷÇÐÐòÁУ¬£¬È»ºó¾ÙÐÐÓмàÊÓµÄͬԴËÑË÷¡£¡£¡£Ñо¿Í¨³£½öÏÞÓÚ¼¸ÖÖ¾­µäµÄLINE/SINEÔª¼þ£¬£¬È±·¦ÖÜȫϵͳµÄ»ùÒò×é±ê׼̽Ë÷¡£¡£¡£Òò´Ë£¬£¬ÖÖÖÖÀàÐ͵ÄÄæ×ªÂ¼×ª×ù×ÓÔÚÈ«»ùÒò×éµÄ׼ȷÂþÑÜͼÆ×¡¢ÉúÎïÌìÉú¡¢¶¯Ì¬×ª±ä¡¢Ç±ÔÚ¹¦Ð§ºÍ×÷ÓûúÖÆÈÔÓдýÆÊÎö¡£¡£¡£

¿ËÈÕ£¬£¬ngµç×ÓÓÎÏ·ÉúÃü¿ÆÑ§Ñ§ÔºÑ»ª/ÇüÁ¼ðÀ½ÌÊÚÍŶӿª·¢ÁËÔÚÈ«»ùÒò×é¼ì²âÄæ×ªÂ¼×ª×ù×ÓµÄÐÂÅÌËãÒªÁìretroSeeker¡£¡£¡£Í¨¹ý½«Äæ×ªÂ¼×ª×ù×ÓÊÂÎñµÄÉúÎïѧģ×Ó£¨¸´ÖÆ-Õ³Ìù£©Ó³Éäµ½½ÏÁ¿»ùÒò×éѧÊý¾Ý£¨gapºÍfill£©ÖУ¬£¬retroSeekerËã·¨Äܹ»×¼È·µØÊ¶±ðÈκÎÎïÖÖ»ùÒò×éÖеÄÐÂÄæ×ªÂ¼×ª×ù×Ó¡£¡£¡£Ïêϸ¶øÑÔ£¬£¬Ç×±¾»ùÒòµÄ±£´æ±¬·¢ÁËÒ»¸ö¡°Ìî³ä¡±£¨fill£©ÇøÓò£¬£¬¶ø¡°¸´ÖÆ-Õ³Ìù¡±Àú³ÌÔòÔÚеĻùÒò×ù±¬·¢ÁËÒ»¸ö¡°¼ä϶¡±£¨gap£©ÇøÓò£¬£¬Í¨¹ý½«ÎïÖÖ¼äµÄ»ùÒò×é¾ÙÐÐÁ½Á½±È¶Ô£¬£¬¿ÉÒÔ¸´ÏÖÕâЩ¡°Ìî³ä¡±ºÍ¡°¼ä϶¡±ÇøÓòÒÔ»ñµÃºòÑ¡µÄת×ù×ÓÇøÓò (ͼ1A)¡£¡£¡£±ðµÄ£¬£¬Æ¾Ö¤Äæ×ªÂ¼×ª×ùµÄTPRT£¨target-site primed reverse transcription£©»úÖÆ£¬£¬Äæ×ªÂ¼×ª×ù×ӵĸ´ÖÆÍùÍù»¹ÐèÒª½èÖúÆäpoly(A) β°Í£¬£¬ÇÒÔÚ²åÈëлùÒò×ùºó£¬£¬Äæ×ªÂ¼×ª×ù×ÓÁ½²à»¹»áÐγɱê¼ÇÐÔµÄTSD£¨target site duplications£©ÐòÁС£¡£¡£Òò´Ë£¬£¬Ò»µ©retroSeekerÈ·¶¨ÁËDZÔÚµÄÄæ×ªÂ¼ÇøÓò£¬£¬Ëü»áÁ¬Ã¦Ê¹Óö¯Ì¬ÍýÏëËã·¨¶Ô²àÒíµÄTSDºÍpoly(A)Ðòö¾ÙÐÐËÑË÷ºÍÆÀ·Ö£¬£¬×îÖÕ»ñµÃ¸ßÖÃÐŶȵÄÄæ×ªÂ¼×ª×ù×ÓºòÑ¡ (ͼ1A)¡£¡£¡£Í¨¹ýÄ£ÄâÊý¾ÝºÍÕæÊµÊý¾ÝµÄ²âÊÔ£¬£¬retroSeekerËã·¨ÌåÏÖ³ö¸ß¶ÈÌØÒìÐÔ¡¢¸ßѸËٶȺͿìËÙµÄÔËÐÐËÙÂÊ¡£¡£¡££¨Í¼1B-E£©¡£¡£¡£

012E3ECD51A9073CE41B57C4F9D_DA84D5EC_118DC

ͼ1 ÅжÏÄæ×ªÂ¼×ª×ù×ÓµÄÐÂÅÌËãÒªÁìretroSeeker¸ÅÀÀ

Ó¦ÓÃretroSeekerËã·¨ÓÚÈË¡¢Ð¡ÊóºÍ¹ûÓ¬»ùÒò×飬£¬retroSeekerÅжÏÁË´óÅúÐÂÀàÐ͵ÄÄæ×ªÂ¼×ª×ù×Ó£¬£¬²¢½âÂëËüÃǵÄÉúÎﱬ·¢¡¢±í´ï¡¢½ø»¯ºÍDZÔÚ¹¦Ð§¡£¡£¡£ÓÉÓÚretroSeeker¿É¶Ôת×ù×ӵIJåÈëλÖþÙÐе¥¼î»ù¾«¶ÈµÄÅжÏ£¬£¬Ñо¿ÍŶӷ¢Ã÷´ó´ó¶¼ÐµÄÄæ×ªÂ¼×ª×ù×ÓÌåÏÖ³öÌØ¶¨µÄL1ÄÚÇÐøÇиî»ùÐò£¬£¬ÆäÖÐһЩ»ùÐò׼ȷְλÓÚ²åÈëλµãÉÏÓεÄ10¸öºËÜÕËᣨͼ2A£©¡£¡£¡£Á¬Ïµ´ó¹æÄ£µÄ»ùÒò±í´ïÊý¾Ý£¬£¬·¢Ã÷´ó×ڵĺòѡй¦Ð§»ùÒò¿ÉÄÜͨ¹ýÄæ×ªÂ¼×ªÎ»»úÖÆ±¬·¢£¬£¬ÀýÈ磬£¬Ò»Ð©ÂѰױàÂë»ùÒò×Ô¼º²»¾ß±¸±àÂëmiRNAµÄÄÜÁ¦£¬£¬¿ÉÊÇͨ¹ýÄæ×ªÂ¼×ª×ùÐγÉת×ù×Ӻ󣬣¬Äܹ»½øÒ»²½±¬·¢ÐµÄmiRNA»ùÒò£¨Í¼2B£©¡£¡£¡£ÓÐȤµÄÊÇ£¬£¬Ñо¿ÍŶӻ¹·¢Ã÷ÁË×éÂѰ׻ùÒò¡¢ÏßÁ£Ìå»ùÒòºÍvault RNA»ùÒòͨ¹ýÄæ×ª×ù×Ó»úÖÆ±¬·¢ÁËÐÂÀàÐ͵ÄÄæ×ªÂ¼×ª×ù×Ó£¨Í¼2C-E£©¡£¡£¡£Á¬ÏµENCODE/CCLE´ó¹æÄ£µÄ×éÖ¯/°©Ö¢±í´ïÊý¾Ý£¬£¬×÷Õß½øÒ»²½ÆÊÎöÁËÄæ×ªÂ¼×ª×ù×ÓµÄ×éÖ¯ÌØÒìÐÔ±í´ï£¬£¬²¢Ö¤ÊµÎúËüÃÇÔÚÖÖÖÖ°©Ö¢ÀàÐÍÖÐµÄÆÕ±é±í´ï¡£¡£¡£×îºó£¬£¬Ó¦ÓÃretroSeekerËã·¨ÓÚ¸ü¶àÎïÖֵĻùÒò×飬£¬Õ¹ÏÖÁËÄæ×ªÂ¼×ª×ù×ÓµÄÖØ´ó½ø»¯Ä£Ê½£¬£¬²¢·¢Ã÷ÁËÐí¶àÎïÖÖÌØÒìÐÔµÄÄæ×ªÂ¼×ª×ù×ÓÊÂÎñ£¨Í¼2F£©¡£¡£¡£×ÛÉÏ£¬£¬¸ÃÑо¿¿ª²»µ«ÅжÏÁËÄæ×ªÂ¼×ª×ù×ÓÔÚ¸÷ÎïÖÖ»ùÒò×éµÄ׼ȷÂþÑÜͼÆ×£¬£¬Ò²Îª½øÒ»²½ÆÊÎöÄæ×ªÂ¼×ª×ù×ÓµÄÌØÕ÷¼°ÆäÔÚÐÄÀíºÍ²¡ÀíÀú³ÌÖеÄDZÔÚ×÷ÓÃÌṩÁËÐÂËã·¨¡£¡£¡£

BCA7393C5147082DC89EAC0A620_AB1D31F6_1BE56

ͼ2 Ó¦ÓÃretroSeeker½âÂëÄæ×ªÂ¼×ª×ù×ÓµÄÉúÎﱬ·¢¡¢±í´ï¡¢½ø»¯ºÍDZÔÚ¹¦Ð§

¸ÃÑо¿ÒÔ¡°RetroSeeker Reveals the Characteristics, Expression, and Evolution of a Large Set of Novel Retrotransposons¡±ÎªÌâ½ÒÏþÔÚAdvanced Biotechnology¡£¡£¡£ngµç×ÓÓÎÏ·ÉúÃü¿ÆÑ§Ñ§ÔºÑ»ª½ÌÊÚ¡¢ÇüÁ¼ðÀ½ÌÊÚΪ¸ÃÏîÊÂÇéµÄÅäºÏͨѶ×÷Õߣ¬£¬²©Ê¿Ñо¿Éú»Æ¾ûºèΪ±¾ÎĵĵÚÒ»×÷Õß¡£¡£¡£¸ÃÑо¿»ñµÃÁ˹ú¼Ò×ÔÈ»¿ÆÑ§»ù½ð¡¢¹ú¼ÒÖØµãÑз¢ÍýÏëµÈÏîÄ¿×ÊÖú¡£¡£¡£

ÂÛÎÄÁ´½Ó£ºhttps://link.springer.com/article/10.1007/s44307-023-00005-5

¡¾ÍøÕ¾µØÍ¼¡¿