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2024Äê3ÔÂ18ÈÕ£¬ÉúÃü¿ÆÑ§Ñ§ÔºµÄÑ»ª/ÇüÁ¼ðÀ/Àî±óÍŶÓÔÚNature CommunicationsÆÚ¿¯ÉϽÒÏþÁËÌâΪ¡°NAP-seq reveals multiple classes of structured noncoding RNAs with regulatory functions¡±µÄÑо¿ÂÛÎÄ¡£¡£¡£¡£¸ÃÑо¿¿ª·¢ÁËNAP-seq²âÐòÊÖÒÕºÍnapSeekerËã·¨£¬ÔÚµ¥¼î»ù¾«¶ÈÅжϾßÓÐÖÖÖÖ×îºóÐÞÊεÄnapRNAµÄÈ«³¤ÐòÁУ¬·¢Ã÷¶àÖÖÐÂÀàÐÍnapRNAºÍ³É°ÙÉÏǧµÄнṹÐÍncRNA£¬ÆÊÎöËüÃÇÔÚ²î±ðµÄϸ°û´Ì¼¤ºÍ¹Ç÷À¼¡·Ö»¯½×¶ÎµÄ¶¯Ì¬×ª±äͼÆ×£¬Õ¹ÏÖÁËnapRNAµÄ±í´ï¡¢¡¢½á¹¹ÌØÕ÷¡¢¡¢ÉúÎïÌìÉúÌØÕ÷¼°ÆäÔÚϸ°û»î¶¯ÖеĹ¦Ð§»úÖÆ£¬ÎªÔÚÖÖÖÖÉúÎïÖз¢Ã÷еĽṹÐÍnapRNA¼°Æä¹¦Ð§»úÖÆÑо¿ÌṩÁËÐÂÒªÁìºÍÐÂ˼Ð÷¡£¡£¡£¡£
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ͼ1. NAP-seqµÄÊÖÒÕÁ÷³Ì
Ñо¿ÍŶӽ«NAP-seqÊÖÒÕÓ¦ÓÃÓÚ¶àÖÖÈËϸ°ûϵ¡¢¡¢Ï¸°ûÓ¦¼¤ºÍСÊó¹Ç÷À¼¡·Ö»¯Ä£×Ó£¬ÔÚÈËÀàºÍСÊóÖз¢Ã÷¶àÖÖÐÂÀà½á¹¹ÐÍnapRNA£¬°üÀ¨Îȹ̱í´ïµÄÏßÐÔÄÚº¬×ÓnapRNA£¨sliRNA£©¡¢¡¢snoRNA-ÄÚº¬×ÓÔÓºÏnapRNA£¨snotron£©¡¢¡¢Ç¶ÔÚmiRNA¾àÀëÇøµÄnapRNA£¨misRNA£©£¬ÒÔ¼°Êýǧ¸öнṹÐÍnapRNA£¨Í¼2£©£¬²¢ÆÊÎöÁËÕâЩnapRNA¿ÉÄܵÄÉúÎïÌìÉúÀú³Ì£¨biogenesis£©¡£¡£¡£¡£±ðµÄ£¬Ñо¿ÍŶӽøÒ»²½ÁªºÏÁËNAP-seqºÍSHAPE-MaPµÈÊÖÒÕ¿ªÕ¹ÁËNAP-SHAPE-MaPÒªÁ죬ÆÊÎöÁËÕâЩnapRNAÔÚÌåÄڵĶþ¼¶½á¹¹¡£¡£¡£¡£²¢ÇÒ£¬Í¨¹ýRNA°ëË¥ÆÚÆÊÎöºÍ±í´ïÆÊÎö·¢Ã÷£¬napRNAÔÚϸ°ûÄÚÎȹ̱í´ï²¢ÔÚ²î±ðµÄϸ°û´Ì¼¤ºÍ·Ö»¯½×¶Î±¬·¢¶¯Ì¬×ª±ä£¬ÕâÌáÐÑnapRNA¿ÉÄܾßÓе÷¿Ø¹¦Ð§¡£¡£¡£¡£ÓÐȤµÄÊÇ£¬Ñо¿ÍŶӻ¹·¢Ã÷»ùÒò×éµÄÖÖÖÖÖØ¸´Ôª¼þ£¨repetitive element£©¿ÉÒÔת¼ºÍ¼Ó¹¤³É¶àÀàнṹÐÍncRNA£¨repRNA£©£¬°üÀ¨box C/D£¬box H/ACAºÍ¾ÛºÏøIIIת¼µÄncRNA¡£¡£¡£¡£Ö÷ÒªµÄÊÇ£¬NAP-seqÅжϵ½ÏÖÔÚΪֹ×µÄнṹÐÍbox C/DºÍH/ACA»ùÒò£¬Õ¹ÏÖ³öËüÄܾò¿ÍÖÖÖÖ³¤¶ÈnapRNAµÄǿʢDZÄÜ¡£¡£¡£¡£
Ñо¿ÍŶÓͨ¹ý¹¦Ð§»ñµÃ¡¢¡¢¹¦Ð§È±Ê§ºÍ¼î»ùÍ»±äµÈʵÑé·¢Ã÷£¬Ð¡Êó¹Ç÷À¼¡·Ö»¯Àú³ÌÖÐϵ÷±í´ïµÄÒ»¸öнṹÐÍnapRNA£¨mmu-novel-CD-6£©¾ßÓÐÒÖÖÆ¹Ç÷À¼¡Ï¸°û·Ö»¯µÄDZÔÚµ÷¿Ø¹¦Ð§¡£¡£¡£¡£Í¨¹ý½ø»¯ÊؾÉÐÔÆÊÎöºÍNAP-SHAPE-MaP½á¹¹²âÐòÆÊÎö£¬Ñо¿ÍŶӷ¢Ã÷Ò»¸öеĽṹÐÍnapRNA¡ªDINAP£¬ËüÊÇÒ»¸ö°üÀ¨box C/DºÍbox H/ACA½á¹¹µÄÔÓºÏnapRNA·Ö×Ó¡£¡£¡£¡£DINAP´ÓÈ˵½·ÇÖÞצ󏽸»¯¸ß¶ÈÊØ¾É£¬ÌáÐÑDINAP¿ÉÄÜÐÐʹÖ÷ÒªµÄÉúÎïѧ¹¦Ð§¡£¡£¡£¡£ÎªÁËÆÊÎöDINAPµÄÉúÎïѧ¹¦Ð§£¬Ñо¿ÍŶÓʹÓÃ×ÔÖ÷¿ª·¢µÄstarBase5ƽ̨¾ÙÐл¥×÷ÂѰ××éÆÊÎö²¢Íê³É¶à¸öÌåÄÚʵÑ飬·¢Ã÷ºÍ֤ʵDINAPÓë¼ÙÄòà×ऺϳÉøDKC1Ï໥×÷Óᣡ£¡£¡£Í¨¹ý½øÒ»²½Ê¹Ó÷ÅÏß¾úͪ׷×ÙʵÑ飬·¢Ã÷DINAPÓëDKC1ÂѰ׻¥×÷»áÓ°ÏìDKC1ÂѰ׵ÄÎȹÌÐÔ¡£¡£¡£¡£²¢ÇÒϸ°û±íÐÍʵÑéЧ¹ûÅú×¢£¬DINAPͨ¹ýά³ÖDKC1ÂѰ׵ÄÎȹÌÐÔÀ´Ôö½øÏ¸°ûÔöÖ³£¨Í¼2£©¡£¡£¡£¡£
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ͼ2. napRNAµÄϵͳ¾ò¿Í¼°¹¦Ð§»úÖÆÑо¿
ÉúÃü¿ÆÑ§Ñ§ÔºµÄÑ»ª½ÌÊÚ¡¢¡¢ÇüÁ¼ðÀ½ÌÊÚºÍÀî±ó¸±½ÌÊÚΪ±¾ÎÄͨѶ×÷Õߣ¬ngµç×ÓÓÎÏ·ÉúÃü¿ÆÑ§Ñ§ÔºÌØÆ¸¸±Ñо¿Ô±ÁõÊ÷éźͲ©Ê¿Ñо¿Éú»Æ¾ûºèΪ±¾ÎĵÄÅäºÏµÚÒ»×÷Õߣ»¸ÃÑо¿»ñµÃʵÑéÊÒÆäËû³ÉÔ±µÄ´óÁ¦Ö§³Ö¡£¡£¡£¡£ngµç×ÓÓÎÏ·ÉúÃü¿ÆÑ§Ñ§ÔºÎªµÚÒ»×÷Õßµ¥Î»¡£¡£¡£¡£±¾Ñо¿Êܵ½¿Æ¼¼²¿ÖصãÑз¢ÏîÄ¿¡¢¡¢¹ú¼Ò×ÔÈ»¿ÆÑ§»ù½ðÏîÄ¿×ÊÖú¡£¡£¡£¡£
ÂÛÎĵÄÁ´½ÓµØµã£º£º£ºhttps://www.nature.com/articles/s41467-024-46596-y